Ao longo de sua história, a IURD tem sido alvo de inúmeras controvérsias e acusações, incluindo desvio de dinheiro, abuso psicológico e fraude. No entanto, a igreja continua a se expandir, contando com milhões de seguidores no Brasil e no exterior. Sua estrutura organizacional altamente centralizada e seu estilo de liderança autoritário têm sido criticados por diversos setores da sociedade.